戊二醛被譽為是繼甲醛和環氧乙烷消毒劑之后化學消毒滅菌劑發展史上的第三個里程碑。戊二醛屬高效消毒滅菌劑，具有殺菌譜廣、殺滅細菌芽孢效果可靠，殺菌作用受有機物的影響小、對金屬的腐蝕性小等特點。適用于不耐熱的醫療器械和精密儀器的消毒滅菌，尤其是內窺鏡的消毒滅菌。通常是用2%的戊二醛溶液浸泡或擦拭進行消毒滅菌。衛生部的《消毒技術規范》規定：對醫療器械的滅菌處理，需用2%的戊二醛溶液浸泡10小時；對一般細菌繁殖污染物的消毒，需用2%的戊二醛溶液浸泡或擦拭10分鐘；對肝炎病毒污染表面的消毒，需用2%的戊二醛溶液浸泡或擦拭30分鐘；還用于環境消毒。也用于與其它活性成分復配使用。